Variazioni interindividuali nell'efficacia e nella tossicità dei vaccini

Oggi vi presento un articolo che pone l'attenzione su come i diversi vaccini possano avere diversa efficacia nei diversi individui e, purtroppo, anche diversi effetti collaterali. E un articolo interessante, perchè si pone il problema del perchè alcuni individui soffrano di eventi avversied altri no. Capire questo è fondamentale per le future strategie di sviluppo di prodotti immunizzanti meglio tollerati, nonchè per meglio difendersi quando, in caso di eventi avversi, le autorità che dovrebbero denunciarli si trincerano dietro un "ma ne facciamo milioni di questi vaccini e sono tollerati benissimo".
L'articolo "Variazioni interindividuali nell'efficacia e nella tossicità dei vaccini"  è del 2010 ed è stato pubblicato alle pagine 204-210 del numero 278 della rivista "Toxicology" edita dalla casa editrice Elsevier.

Variazioni interindividuali nell'efficacia e nella tossicità dei vaccini

Chandan Thomasa, Majid Moridanib,∗

a Department of Pharmaceutical Sciences, School of Pharmacy, Lake Erie College of Osteopathic Medicine, Bradenton, FL 34211, USA

b Department of Pharmaceutical Sciences, School of Pharmacy, Texas Tech University Health Sciences Center, 1406 Coulter, Amarillo, TX, 79106, USA

 

Abstract
Un certo numero di vaccini attualmente disponibili hanno mostrato differenze significative nella grandezza della Risposta immunitaria e nella tossicità nei soggetti sottoposti a vaccinazione. Un certo numero di fattori possono essere coinvolti nelle variazioni nelle risposte immunitarie, come l'età, il sesso, la razza, la quantità e la qualità dell'antigene, la dose somministrata e per una certa parte il percorso di somministrazione e la genetica del sistema immunitario. Quindi,diventa imperativo che i ricercatori abbiano strumenti come la genomica e la proteomica a loro disposizione per predire quale gruppo di popolazione sia più probabile che sia non-responsive o sviluppi tossicità per i vaccini. In questo articolo, riportiamo brevemente l'influenza dei biomarkers farmacogenomici sull'efficacia e la tossicità di alcuni dei vaccini più frequentemente oggetto di segnalazione di effetti avversi che hanno mostrato un elevato tasso di variabilità nella risposta immunizzante verso l'epatite B, il morbillo, la parotite, la rosolia, l'influenza e l'AIDS / HIV e nella tossicità.

1. Introduzione
Come avviene per le differenze interindividuali nella risposta farmacologica (Bhathena e Spear, 2008), un certo numero di vaccini attualmente disponibili hanno mostrato differenze significative in termini di grandezza delle risposte immunitarie nei soggetti sottoposti a vaccinazione. È stato ipotizzato che un certo numero di fattori possono essere coinvolti in queste variazioni nelle risposte immunitarie. Questi fattori includono: età, genere, razza, quantità e qualità dell'antigene, dose somministrata e in una certa misura il percorso di somministrazione,e la genetica del sistema immunitario. La maggior parte di questi fattori può essere raggruppata in variazioni causate dalla biologia e dalla genomica dell'ospite e del patogeno. Inoltre, i fattori ambientali quali il fumo, il consumo di alcol e la dieta possono alterare potenzialmente la biologia e fattori genomici (Poland et al., 2008a). In un recente studio (Poland et al., 2007), il termine "vaccinomi" è stato definito come le aree di immunogenetica e immunogenomica che forniscono una migliore comprensione di come una serie di fattori e/o le molecole svolgono un ruolo critico nella regolazione delle risposte immunitarie innate e adattative. Gli esempi di tali molecole includono l'antigene leucocitario umano (HLA), i recettori toll-like (TLR) e le loro componenti di segnalazione, recettori di citochine e geni così come il trasportatore associato all'elaborazione di antigeni (TAP),che svolge un ruolo nel contribuire alle variazioni della risposta immunitaria dovuta a polimorfismi genetici (Poland et al., 2007).
 Il ruolo della genomica nel determinare la portata della risposta immunitaria è ancora nella sua infanzia con solo una manciata di malattie investigate a questo proposito. Alcune delle malattie infettive maggiormente indagate includono il morbillo, l'epatite B, l'epatite C, Papillomavirus umano e influenza (Ovsyannikova et al., 2004, Poland et al., 2008a). Ad esempio, i geni HLA sono i geni più polimorfici nel genoma umano. Inoltre, i geni HLA giocano ruoli critici nell'instaurazione di risposte di cellule T e anticorpi contro gli agenti infettivi. È stato dimostrato il polimorfismo nei geni HLA ha un impatto significativo nel processamento e nella presentazione dei peptidi che provengono da patogeni che in ultima analisi influenzano il tipo di risposte indotte delle cellula T e le delle cellule B.
A causa della crescente quantità di segnalazionio relative alla non risposta a variazioni di risposta negli individui vaccinati, diventa imperativo che i ricercatori abbiano strumenti come genomica e proteomica a loro disposizione per prevedere quale parte della popolazione ha maggiori probabilità di subire effetti tossici per un certo tipo di vaccino somministrato. Inoltre, la norma che "una misura va bene per tutti ", che è stata la base di progettazione di vaccini finora deve sempre più essere riesaminato per la maggior parte dei vaccini (Jacobson e Poland, 2004; Poland ed altri, 2008a).
Nelle sezioni seguenti, abbiamo brevemente esaminato l'influenza della farmacogenomica sull'efficacia e la tossicità di alcuni dei vaccini più frequentemente segnalati per un alto tasso di non-responders, tra cui l'epatite B, il morbillo, la parotite, la rosolia e la malattiaInfluenza, AIDS / HIV (tabella 1).

2. Esempi di variazione dell'efficacia e della tossicità del vaccino
2.1. Epatite A e B
Gli individui vaccinati mostrano una significativa variabilità interindividuale nella risposta immunitaria al vaccino contro l'epatite B. Per esempio,Il vaccino contro l'epatite B approvato è somministrato in dosi di vaccino che vanno da 10 a 40 microg a seconda della popolazione mirata. Oltre alla variazione della dose, segmenti specifici di popolazione falliscono di rispondere al vaccino contro l'epatite B, inclusi individui obesi, fumatori e individui immuno-compromessi. In generale, il 10-15% della popolazione non riesce a rispondere al vaccino attualmente disponibile a tre dosi, mentre circa il 40% della popolazione adolescenziale mostra i livelli di anticorpi che sono considerati protettivi dopo una o due dosi. Ci sono stati casi anche in cui alcuni individui che hanno anche richiesto più di sei dosi di vaccinazione contro l'epatite B per la generazione della risposta immunitaria (Alper et al.,1989).
Le risposte anticorpali alla vaccinazione contro l'epatite B sembrano essere fortemente influenzate dalla variabilità genetica. Tra i diversi fattori, la presenza di genotipi specifici portatori di HLA classe I e III influenzano notevolmente le differenze riportate tra responders e non-responders. Ad esempio, la presenza di alleli HLA-B46 e HLA-B15 è più elevata nei pazienti non-responder in confronto ai responder nella vaccinazione contro l'epatite B. Gli individui con allele HLA-DRB1 * 13 hanno meno probabilità di essere infettati cronicamente dall'epatite B (Davenport et al., 1995; Ovsyannikova et al., 2004). Per affrontare alcune delle domande relative alle differenze osservate, studi su gemelli sono ampiamente usati come metodo per studiare la genetica alla base della variabilità nella risposta immunitaria alla vaccinazione. Utilizzando questo metodo è possibile distinguere chiaramente l 'influenza di fattori genetici e ambientali sulla natura della risposta immunitaria dato che i gemelli monozigotici sono geneticamente identici mentreI gemelli non monozigotici condividono il 50% dei loro geni in media (Hohler et al., 2002).  Pertanto, studi sui gemelli consentono di indagare l'influenza dei fattori genetici che mostrano variabilità nella risposta immunitaria (Jacobson et al., 2007; Poland et al., 2007).
Per esempio, in uno studio condotto in coppie gemelle all'età di 5 mesi, il 77% dellaa variabilità delle risposte anticorpali è stata osservata in risposta all'antigene del virus dell'epatite B (Newport et al., 2004). In un altro studio nella popolazione giapponese è stato riscontrato che DRB1 * 0101, DRB1 * 08032,DPA1 * 0103 e DPB1 * 0402 svolgono un ruolo importante nella produzione delle risposte anticorpali mentre DRB1 * 0405 è stato associato negativamente alla produzione di anticorpi (Hatae et al., 1992; Mineta et al., 1996; Ovsyannikova et al., 2006). Wang et al. (2004) hanno segnalato che HLA-DRB1 * 07 è da associare a non-responders all'antigene dell'epatite B (HBsAg).
Oltre ai geni che codificano il complesso di istocompatibilità maggiore (MHC), anche altri fattori come i polimorfismi in IL-10 e IL-1beta possono svolgere un ruolo nel determinare le risposte immunitarie alla vaccinazione contro l'epatite (Hohler et al., 2002; Yucesoy et al., 2002).In particolare, sono stati individuati polimorfismi di singoli nucleotidi (SNP) capaci di influenzare la quantità di citochine pro-infiammatorie prodotte. Ad esempio, nel caso della vaccinazione contro l'epatite B e A, quasi il 25% dell'ereditabilità totale può essere determinato da Polimorfismi del promotore di IL-10 (Hohler et al., 2005). Polimorfismi del gene IL-1beta alla posizione +3953 nell'esone 5 interssano l'espressione di IL-1beta in risposta a stimoli specifici.  

Comunque, lo studio ha anche scoperto che la distribuzione allelica non ha deviato significativamente dalla distribuzione Hardy-Weinberg, che è stata trovata essere circa il 54% con il genotipo 1,1, 37% con 1,2 e 5,4% con il 2.2. Come mostrato in Fig. 1, il polimorfismo variante 2.2 di IL-1beta (3953) ha mostrato risposte anticorpali significativamente più elevate in confronto con l'allele 1.1.
Inoltre quando la risposta di proliferazione linfocitaria a HBsAg nelle cellule mononucleari del sangue periferico (PBMC) è stata determinata, si è trovato che ci sono state risposte significativamente più elevate in eterozigote o omozigoti per l'allele IL-1beta +3953 (Fig. 2). Questi studi suggeriscono che la risposta immunitaria a HBsAg è stata effettivamente influenzata dalla variante allelica di +3953 IL-1beta (Yucesoy et al., 2002). Lo studio ha portato all'utilizzo del Peptide IL-1beta come adiuvante nelle formulazioni successive dei preparati vaccinali (Boraschi e Tagliabue, 1999; Yucesoy et al., 2002).

2.2. Morbillo, parotite e rosolia
Per il vaccino contro il morbillo, durante l'ultima epidemia americana, il 20-40% di coloro che hanno contratto la malattia era stato precedentemente vaccinato contro il morbillo, indicando che il vaccino usato era inefficace nell'eliminare gli anticorpi neutralizzanti (Jacobson e Poland, 2004).Un esame più approfondito ha rivelato specifiche associazioni genetiche correlate con le scarse risposte immunitarie al vaccino contro il morbillo. I bambini vaccinati contro la rosolia hanno mostrato variazioni di risposta immunitaria soprattutto per quanto riguarda le risposte anticorpali e delle cellule T, che sono state legate a variazioni genetiche dell'ospite (OvsyannikovaEt al., 2004).
Negli individui vaccinati nel morbillo è stata segnalata un'associazione tra geni HLA e livelli molto elevati di anticorpi o risposte iperseropositive. Una frequenza più elevata di responder iperseropositivi agli antigeni del morbillo è stata osservata per gli individui che portano l'allele HLA-B * 07 di classe I. Al contrario, le frequenze dell'allele HLA-B * 44 erano inferiori in iperseropositive rispetto ai normali seropositivi (Jacobson e Poland, 2004; Jacobson et al., 2003). Una associazione significativa è stata osservata tra gli alleli HLA classe II e gli anticorpi circolanti del virus del morbillo (Ovsyannikova et al., 2004; Poland et al., 2001). Questa associazione è stata riportata come specifica per i geni DR, DQ e DP di classe II HLA. Per esempio, gli alleli HLA-DRB1 * 303 e HLA-DPA1 * 0201 sono stati trovati più in seronegative rispetto a quelli sieropositivi (Poland et al., 2001). Inoltre, in uno studio condotto in 100 coppie di gemelli sani (45 monozigoti e 55 dizigoti), ognuno dei quali riceveva 1-2 dosi di vaccino morbillo-parotite-rosolia-II (MMR-II), si è scoperto che l'ereditarietà delle risposte immunitarie a MMR -II differivano per ciascuna delle tre componenti del vaccino. L'ereditarietà per il morbillo era circa il 90% rispetto al 39% e al 46% per i parotite e la rosolia, e questi dati indicano chiaramente che le differenze genetiche svolgono un ruolo significativo nel determinare la portata delle risposte immunitarie dopo la vaccinazione contro il morbillo rispetto alla vaccinazione di parotiti e rosolia (Ovsyannikova et al., 2004, 2005a; Poland et al., 2008a). È stato anche dimostrato che l'IFN-gamma e le risposte di citochine IL-4 in risposta al vaccino del morbillo sono influenzate da geni HLA (Ovsyannikova et al., 2005b, c; Poland et al., 2008a).
Le risposte immunitarie al vaccino contro il morbillo sono influenzate anche dai polimorfismi dei SNP e delle citochine. Ad esempio, i polimorfismi nel gene del virus del morbillo sono capaci di influenzare l'induzione di risposte immunitarie umorali. Due geni dotati di domini che legano il virus del morbillo sono la molecola di attivazione della segnalazione ai linfociti (SLAM) anche nota come CDw150 e la proteina del cofattore a membrana (CD46). Quando SNPs in questi geni sono stati studiati, è stata riportata una chiara associazione tra dose di allele e la grandezza della risposta immunitaria (Dhiman et al., 2007a; Dorig et al., 1993; Poland et al., 2008a; Tatsuo et al ., 2000). In questi studi è stato riscontrato che le risposte IgG specifiche del morbillo hanno mostrato una diminuzione di 4 volte nella risposta immunitaria legata alla dose di allele. Questa diminuzione della risposta immunitaria era stata attribuita a una rappresentazione più elevata di SNP nell'esone 7 (rs3796504) nel gene SLAM. Al contrario, una diminuzione della risposta anticorpale al morbillo è stata osservata a causa di un SNP nell'esone 3 (rs164288) del gene SLAM. Gli autori hanno postulato dai dati che vi era la possibilità che tali SNPs potessero influenzare la capacità di legame del virus del morbillo ai recettori (Dhiman et al., 2007a). Inoltre, dopo la vaccinazione con il vaccino del morbillo è stata osservata una maggiore proliferazione di IgG e linfociti se vi è un SNP all'interno del gene IL-12 e risposte più basse se i SNP erano all'interno del gene IL-10 e IL-12R (Dhiman et al., 2007b; Poland et al., 2008a).
  È stato inoltre studiato il ruolo dei polimorfismi TLR e delle risposte immunitarie specifiche del morbillo e si è scoperto che le risposte immunitarie venivano alterate con una rappresentazione differenziale di SNP in alcune varianti geniche. Ad esempio, dopo la vaccinazione contro il morbillo, sono state riscontrate risposte inferiori di anticorpi con una variante eterozigote per rs3775291 del gene TLR. Allo stesso modo, un SNP nella 3'UTR (regione non tradotta) del gene TLR3 ha anche dimostrato basse risposte (Dhiman et al., 2008).
È stata segnalata anche l'associazione di geni HLA e parotite. È stato dimostrato che le risposte IgA sono state aumentate dopo la vaccinazione dagli antigeni di parotite e questo è stato correlato con gli antigeni DR3 e DR4. È interessante notare che l'associazione di risposte immunitarie con HLA è stata osservata solo nelle risposte IgA e non nelle risposte IgM e IgG dopo la vaccinazione contro la parotite (Hyoty et al., 1986). Per l'infezione della rosolia, le popolazioni femminili mostrano livelli più elevati di anticorpi rispetto ai maschi a seguito dell'infezione.Similmente, dopo la vaccinazione con la rosolia, le risposte immunologiche specifiche della rosolia osservate nelle femmine erano più alte rispetto ai maschi. Ciò si riflette anche nel fatto che le femmine mostrano più la tendenza verso lo sviluppo di reazioni avverse dopo la vaccinazione con il vaccino della rosolia. La risposta proliferativa dei linfociti non è tuttavia particolarmente influenzata dal sesso e dall'età della popolazione. È interessante notare che i geni della classe I HLA non influenzano l'entità della risposta immunitaria dopo la vaccinazione contro la rosolia, anche se alcuni studi che la suggerivano ma non conclusivi sono stati riportati (Benjamin et al., 1992; Mitchell, 1999; Ovsyannikova et al. 2006).

2.3 Influenza
 La precisa costituzione di un vaccino antinfluenzale, disponibile ora da più di mezzo secolo, è incerta. La dose del vaccino contro l'influenza ha subito cambiamenti significativi dalla sua approvazione. Attualmente esistono due tipi principali di vaccini contro l'influenza disponibili per la prevenzione dell'influenza epidemica ogni anno il vaccino trivalente inattivato ed il vaccino attenuato. Per il vaccino contro l'influenza, i polimorfismi genetici sembrano essere importanti per spiegare le variazioni osservate per le risposte immunitarie fatte contro il virus dell'influenza (Poland et al., 2008b).
C'è una notevole quantità di ereditarietà nella misura della risposta immunitaria protettiva alla vaccinazione contro l'influenza anche quando si utilizza una dose costante di vaccino, la stessa formulazione e la stessa via di somministrazione (Poland et al., 2008b). Le associazioni HLA sono state riportate per le variazioni di risposta immunitaria ai vaccini influenzali (Poland et al., 2008b) specificamente molecole HLA classe II. Nel caso di vaccino inattivato di influenza, è stato riportato che DRB1 * 07 contribuisce alla non-responsività rispetto alla popolazione responder al vaccino influenzale (Lambkin et al., 2004; Poland et al., 2007). Inoltre, in studi separati è stato riscontrato che gli alleli HLA-DRB1 * 0701 e HLA-DQB1 * 0303 si verificano con maggior frequenza nei non-responder rispetto ai responder. Al contrario, gli alleli HLADRB4 * 01 e HLA-DQB1 * 02 non hanno mostrato differenze tra i responder e quelli nonresponder. È stata inoltre segnalata un'associazione dell'allele HLA-DQB1 * 0603-9 / 14 e la non reattività al vaccino influenzale (Gelder et al., 2002; Lambkin et al., 2004). Inoltre, nel caso degli antigeni dell'influenza A, è stato dimostrato che HLA-Bw35 contribuisce alla fase iniziale della risposta immunitaria mentre HLA-Bw16 è associato a una risposta immunitaria ridotta (Cunningham-Rundles et al., 1979; Mackenzie et al ., 1977). Nel caso di vaccino intranasale influenzale A attenuato vivo, l'allele HLA-Bw16 è associato con una diminuzione della risposta immunitaria (Spencer et al., 1976). Sono state anche riportate associazioni di predisposizioni ereditarie a morte per influenza. Questo studio è stato condotto in Utah utilizzando dati della parte di popolazione morta negli ultimi 100 anni a causa dell'influenza. Lo studio ha riferito che i parenti stretti e distanti di persone morti di influenza avevano un rischio significativamente maggiore di morire dall'influenza (Albright et al., 2008).
Inoltre, anche lo sviluppo di vaccini per gli anziani è una grande preoccupazione. Un tasso di mortalità quasi del 90% è stato riportato negli anziani durante un'epidemia di influenza. Rispetto agli adulti più giovani che mostrano fino al 65-80% la protezione contro l'influenza, gli individui anziani mostrano solo tra il 30 e il 50% la protezione contro la malattia e hanno anche una bassa reattività al vaccino (Effros, 2003, Remarque et al. Ruh et al., 1998; Webster, 2000) e quindi può richiedere l'aumento delle dosi vaccinali. Tuttavia le risposte IgG e IgA superiori non necessariamente significano una migliore risposta di inibizione della emagglutinazione (Remarque et al., 1999). Tutti questi dati sono molto significativi dato che ci forniscono un'idea di una popolazione che potrebbe non essere protetta usando le attuali strategie di vaccinazione o contro una nuova epidemia di influenza. Ad esempio, l'epidemia di aprile 2009 del virus dell'influenza aviaria A (S-OIV A, H1N1) ha chiaramente indicato che le strategie di vaccinazione esistenti, tra cui il vaccino stagionale di influenza inattivato contro l'influenza come anche il vaccino attenuato vivo, non fornivano alcuna protezione contro H1N1 virus (Chang ed altri, 2009; Katz et al., 2009).

2.4. AIDS/HIV
L'AIDS è una delle malattie più letali che hanno afflitto l'umanità da quando è stato segnalato all'inizio degli anni '80. Lo sviluppo di vaccini contro l'AIDS ha affrontato per molti anni una grave difficoltà che è la diversità dei ceppi di tipo 1 (HIV-1) o dei suoi prodotti genetici (McBurney e Ross, 2008). La diversità in particolare nella busta (Env) glicoproteina è il principale ostacolo che oggi stiamo affrontando nel disegno del vaccino contro l'AIDS. Un gran numero di studi sui vaccini non è riuscito a partire dal primo vaccino contenente solo Env fino ai recenti esperimenti Vaxgen. L'idea del design del vaccino è cambiato negli anni in seguito a questi fallimenti, inizialmente con la maggior parte dei vaccini che si concentravano sull'evoluzione anticorpale umorale verso gli studi più recenti che sono diretti verso l'immunità mediata di cellule T generata (Letvin, 2006; McBurney e Ross , 2008, Sekaly, 2008, Thorner e Barouch, 2007). Tuttavia, il processo di vaccinazione fallimentare da parte di Merck recentemente ha suscitato preoccupazioni perché questo vaccino ha infatti portato ad un aumento del rischio di infezione da HIV (McBurney e Ross, 2008).
È stato riportato che il genotipo HIV-1 ha un impatto significativo per quanto riguarda la suscettibilità all'infezione da HIV e quindi la comprensione delle sfumature diventa una direzione importante verso lo sviluppo del vaccino (Kulkarni et al., 2008). È stato riportato che entrambi i loci di classe I e II HLA influenzano la suscettibilità e la resistenza all'infezione. La resistenza all'infezione da HIV-1 risulta essere a causa di HLA-DRB1 * 01 (MacDonald et al., 2000). Inoltre, è stato riscontrato che il supertipo A2 / 6802, che è un gruppo di alleli HLA strettamente correlati, è associato con una diminuzione dell'infezione da HIV-1. È noto da qualche tempo che i recettori della chemochina della superficie cellulare CCR5 e CXCR4 svolgono un ruolo fondamentale nell'entrata del virus nelle cellule. Recentemente Kulkarni et al. (2008) ha studiato il ruolo dei polimorfismi del principale co-ricettore dell'HIV; CCR5 e CCL3L1 che è un potente ligando di CCR5 e la chemochina HIV-soppressiva nella suscettibilità all'infezione, nonché il suo ruolo nella valutazione e nell'efficacia del vaccino. Gli autori hanno proposto in questo studio che la direzione del disegno di vaccini terapeutici dovrebbe essere per ridurre l'infettività dell'ospite e il ruolo della farmacogenomica diventa sempre più importante come evidente da questi studi. Recentemente nell'agosto 2007 la FDA ha approvato il Maraviroc che è un antagonista del co-ricettore CCR5, per essere utilizzato in combinazione con farmaci antiretrovirali nei pazienti adulti infettati dal virus resistente a più farmaci: virus CCR5-tropico HIV-1 che utilizza CCR5 per la penetrazione cellulare rispetto ad un virus CXCR4-tropico che utilizza CXCR4 per la penetrazione cellulare. Attualmente è disponibile un test di tropismo per il co-recettore negli Stati Uniti, che è costoso e non è molto sensibile. Quindi lo sviluppo di un test molto più sensibile e conveniente aumenterebbe significativamente l'efficacia della terapia di Maraviroc (Lieberman-Blum et al., 2008). Inoltre, lo sviluppo di un più sensibile test CCR5 può essere utile nello sviluppo del vaccino.
Inoltre, pur avendo anticorpi monoclonali (mAb) a tutti i ceppi di HIV e studi che riportano la capacità di questi mAb di neutralizzare i virus HIV in vitro e di una protezione completa nei modelli animali (Gauduin et al., 1997; Mascola et al ., 2000; McMichael, 2006; Parren et al., 2001; Rappuoli, 2007), il successo di un vaccino contro l'AIDS è ancora un sogno lontano. Questo è dovuto alla mancanza di una comprensione completa del sistema immunitario di entrambi ospite e patogeno, che come abbiamo accennato in precedenza è diventato il centro dei ricercatori del vaccino contro l'AIDS. Infine, molti altri esempi hanno mostrato un legame tra il polimorfismo HLA e la risposta immunitaria contro un vaccino che illustra il suo significato. La creazione di forti associazioni tra i geni HLA e la variabilità di risposta immunitaria, nonché con altre classi di geni di risposta immunitaria attraverso la profilogenizzazione immunogenetica, porteranno alla fine un vaccino molto migliorato e molto più efficace. Ciò porterà ad una maggiore copertura vaccinale, meno fallimenti e risposte negative e, in ultima analisi, riduzione dei costi di vaccinazione.

3. La genomica nello sviluppo dei vaccini
Attualmente lo sviluppo del vaccino si basa sul partire da una sequenza genomica nota di un agente patogeno per identificare un antigene adatto. Tuttavia, a causa del completamento del progetto genoma umano, nonché di progetti genomici di alcuni patogeni batteriali e microbici e anche grazie ai progressi tecnici conseguiti nel campo della biotecnologia, l'identificazione e lo sviluppo di un antigene potrebbero essere raggiungibili in pochi anni. Al contrario, nell'epoca pre-genomica, i metodi di identificazione di un antigene erano molto laboriosi, molto costosi e consumavano un tempo compreso tra i 5 ei 15 anni. L'attuale sviluppo di vaccini basati sul genoma che è stato definito come "vaccinologia inversa" come mostrato nella Figura 3, dal pioniere in questo campo, Rino Rappuoli, responsabile globale della ricerca, Vaccini e diagnosi di Novartis, promette un grande futuro per le malattie infettive attualmente mortali che stiamo affrontando oggi (Rappuoli, 2000; Serruto et al., 2009).
La vaccinologia inversa è stata testata per la prima volta per lo sviluppo del vaccino contro il serogrouppo B di Nisseria meningitidis (MenB). Il vaccino disponibile contro i meningococchi non era efficace contro il serogrouppo B poiché il polisaccaride capsulare nel vaccino coniugato era scarsamente immunogenico e autoimmune. Inoltre, poiché i ceppi MenB sono altamente variabili, il vaccino attuale non è riuscito a fornire protezione contro questo particolare ceppo (Rappuoli, 2000). Tuttavia, con l'uso di vaccinologia inversa che si basava sull'intero sequenziamento del genoma del ceppo MenB, è stato sviluppato un vaccino che è ora in studi clinici. I dettagli di sviluppo di questo vaccino sono al di là del campo di applicazione della presente revisione e sono trattati in dettaglio in diverse altre revisioni e articoli di ricerca originali (Giuliani et al., 2006; Pizza et al., 2000; Rappuoli, 2000; Serruto et al. 2009; Tettelin et al., 2000). Oltre al vaccino MenB, molti altri antigeni potenziali vaccinali sono già stati sottoposti a screening e molti sono in fase di sviluppo utilizzando questa metodologia. Alcuni esempi includono un vaccino basato su pili contro la S. pneumonia, il vaccino basato sul pan-genoma (un repertorio globale di geni di una specie specifica) per S. agalactiae e Streptococcus del gruppo B . Lo sviluppo del vaccino pan-genoma è un approccio genomico globale che offre una selezione più ampia di ceppi che possono essere inclusi nella formulazione del vaccino (Muzzi et al., 2007). Altri esempi che hanno utilizzato la metodologia genomica sono P. gingiivalis, S. pyogenes, C. pneuomoniae, B. anthracis. Inoltre, è stato suggerito che lo sviluppo di vaccini basati sul genoma possa essere possibile per una serie di importanti malattie quali la malaria, l'epatite C, la tubercolosi, la sifilide (Rappuoli, 2000).

È stato sottolineato da Rappuoli, che la vaccinologia inversa è insufficiente quando il candidato vaccino non è una proteina, ad esempio polisaccaridi (Shadan, 2004). Di conseguenza, lo sviluppo futuro del vaccino deve tener conto di diversi approcci combinati con la vaccinologia inversa per essere efficaci nella produzione di candidati efficaci per i vaccini. Questo include l'uso di tecniche di ingegneria genetica in combinazione con la vaccinologia strutturata (Dormitzer et al., 2008). Recentemente, per affrontare le carenze di un certo numero di programmi software attualmente disponibili per la prevenzione e l'identificazione del target di un vaccino, è stato sviluppato un nuovo sistema di progettazione vaccinale Vaxign e reso pubblicamente disponibile sul web (Xiang and He, 2009). Lo sviluppo post-genomico del vaccino porta nuove speranze per la produzione di vaccini contro le malattie che abbiamo fallito o di controllare nonostante sia disponibile un vaccino o per le quali non siamo riusciti a sviluppare un vaccino effettivo nell'era pre-genomica.

4. Biomarcatori ed il loro potenziale nello sviluppo dei vaccini
 I profili genomici e proteomici della popolazione vaccinata possono essere confrontati con la sottopopolazione che subisce effetti avversi della vaccinazioni. Tali confronti possono essere utilizzati per identificare e convalidare i biomarcatori per eventuali effetti avversi dovuti alle vaccinazioni.

 Ad esempio, il virus vaccinale utilizzato per la vaccinazione contro il vaiolo è associato ad un certo numero di eventi avversi. Ciò è dovuto al fatto che la risposta immunitaria generata dopo la vaccinazione contro il vaiolo è maggiore di quanto richiesto (Kemper et al., 2002; Reif et al., 2009). A questo proposito, Reif e collaboratori hanno recentemente effettuato un'analisi integrata dei dati genetici e proteomici per l'identificazione di biomarcatori associati a eventi avversi dopo la vaccinazione contro il vaiolo (Reif et al., 2009). Per studiare gli eventi avversi dopo la vaccinazione contro il vaiolo, sono stati impiegati 1442 SNP per la valutazione di fattori genetici e 108 determinazioni di siero cellulare per studiare i fattori proteomici. Reif et al. (2009) hanno concluso da questo studio che gli eventi avversi dopo la vaccinazione contro il vaiolo sono associati ad un insieme di candidati genetici e proteomici, come ICAM-1, IL-10, IL-4 e CSF-3. Gli autori hanno suggerito che il modello proposto in questo studio potrebbe essere utilizzato come strumento diagnostico per la previsione di eventi avversi. Tuttavia, gli autori avvertono che occorrono ulteriori studi condotti a questo proposito insieme ad altri fattori che possono influenzare anche le risposte (Reif et al., 2009).
 I biomarcatori sono anche utili per lo sviluppo di sostanza potenziali candidati come vaccini . Attualmente, la maggior parte dei vaccini disponibili e i candidati di vaccino disponibili utilizzano determinazioni come i test di proliferazione delle cellule T, la profilazione delle citochine e le risposte anticorpali specifiche per l'antigene o il peptide in questione come mezzo per valutare il successo di un vaccino. Tuttavia, con un'ampia varietà di vaccini basati su diversi antigeni e peptidi, diventa difficile correlare i risultati ottenuti direttamente ad un determinato esito clinico. Quindi, l'individuazione di alcuni biomarcatori comuni sarebbe un mezzo eccellente per una vaccinazione efficace per quanto riguarda la conformità dei pazienti, l'efficacia dei costi e ridurre la quantità di tempo necessario per lo sviluppo del vaccino.

5.Riassunto
 Con il crescente numero di effetti collaterali associati ad un certo numero di vaccini riportati nel corso degli anni, è diventato imperativo sviluppare nuove tecnologie che possano aiutare efficacemente lo sviluppo e la valutazione dei vaccini per l'efficacia e la tossicità. L'uso di DNA, RNA e microarray di proteine offre un certo numero di vantaggi, come una maggiore flessibilità del numero di geni e dei prodotti genetici che possono essere testati nella valutazione del vaccino e della risposta immunitaria sui metodi tradizionalmente utilizzati che valutano in vivo la complessiva efficacia e la risposta tossicologica a una formulazione del vaccino (Regnstrom, 2008; Thomas et al., 2009). Tale tecnologia può essere utilizzata anche per valutare e confrontare l'effetto farmacologico e immunostimolatorio dell'antigene vaccino, dell'adiuvante e della combinazione sull'espressione di RNA e proteine. Queste valutazioni possono essere effettuate inizialmente negli studi preclinici sugli animali e successivamente negli studi clinici umani. I genomi e gli studi proteomici nello sviluppo del vaccino possono fornire indizi vitali per quanto riguarda le variazioni degli esiti farmacologici come l'infiammazione, la risposta allo stress, l'apoptosi e la cancerogenicità (Regnstrom et al., 2002, Regnstrom, 2008, Thomas et al., 2009).
L'era dell'immunogenomica è arrivata veramente e può benissimo avere la chiave per le future scoperte e i progressi nel design e nello sviluppo dei vaccini e nel miglioramento della salute pubblica. Tali informazioni possono essere utili per identificare i non-responder e gli individui a rischio di sviluppare effetti collaterali e per comprendere il meccanismo sottostante della risposta immunitaria alla vaccinazione. La tecnologia genomica consente inoltre di sviluppare vaccini contro agenti patogeni attualmente difficili da coltivare in laboratorio.

Dichiarazione di conflitto di interessi
Gli autori dichiarano che non vi sono conflitti d'interesse.

Finanziamenti
Nessuno dichiarato. 

Riferimenti

Albright, F.S., Orlando, P., Pavia, A.T., Jackson, G.G., Cannon Albright, L.A., 2008. Evidence for a heritable predisposition to death due to influenza. J. Infect. Dis. 197, 18–24.

Alper, C.A., Kruskall, M.S., Marcus-Bagley, D., Craven, D.E., Katz, A.J., Brink, S.J., Dienstag, J.L., Awdeh, Z., Yunis, E.J., 1989. Genetic prediction of nonresponse to hepatitis B vaccine. New Engl. J. Med. 321, 708–712.

Benjamin, C.M., Chew, G.C., Silman, A.J., 1992. Joint and limb symptoms in children after immunisation with measles, mumps, and rubella vaccine. BMJ 304, 1075–1078.

Bhathena, A., Spear, B.B., 2008. Pharmacogenetics: improving drug and dose selection. Curr. Opin. Pharmacol. 8, 639–646.

Boraschi, D., Tagliabue, A., 1999. Interleukin-1 and interleukin-1 fragments as vaccine adjuvants. Methods 19, 108–113.

Chang, L.Y., Shih, S.R., Shao, P.L., Huang, D.T., Huang, L.M., 2009. Novel swine-origin influenza virus A (H1N1): the first pandemic of the 21st century. J. Formos. Med.Assoc. 108, 526–532.

Cunningham-Rundles, S., Brown, A., Gross, D., Braun, D., Hansen, J.A., Good, R.A.,Armstrong, D., Dupont, B., 1979. Association of HLA in immune response to influenza-A immunization. Transplant Proc. 11, 1849–1852.

Davenport, M.P., Quinn, C.L., Chicz, R.M., Green, B.N., Willis, A.C., Lane, W.S., Bell, J.I., Hill, A.V., 1995. Naturally processed peptides from two disease-resistanceassociated HLA-DR13 alleles show related sequence motifs and the effects of the dimorphism at position 86 of the HLA-DR beta chain. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92, 6567–6571.

Dhiman, N., Poland, G.A., Cunningham, J.M., Jacobson, R.M., Ovsyannikova, I.G.,Vierkant, R.A., Wu, Y., Pankratz, V.S., 2007a. Variations in measles vaccine specific humoral immunity by polymorphisms in SLAM and CD46 measles virus receptors. J. Allergy Clin. Immunol. 120, 666–672.

Dhiman, N., Ovsyannikova, I.G., Cunningham, J.M., Vierkant, R.A., Kennedy, R.B., Pankratz, V.S., Poland, G.A., Jacobson, R.M., 2007b. Associations between measles vaccine immunity and single-nucleotide polymorphisms in cytokine and cytokine receptor genes. J. Infect. Dis. 195, 21–29.

Dhiman, N., Ovsyannikova, I.G., Vierkant, R.A., Ryan, J.E., Pankratz, V.S., Jacobson,R.M., Poland, G.A., 2008. Associations between SNPs in toll-like receptors and related intracellular signaling molecules and immune responses to measles vaccine:preliminary results. Vaccine 26, 1731–1736.

Dorig, R.E., Marcil, A., Chopra, A., Richardson, C.D., 1993. The human CD46 molecule is a receptor for measles virus (Edmonston strain). Cell 75, 295–305.

Dormitzer, P.R., Ulmer, J.B., Rappuoli, R., 2008. Structure-based antigen design: a strategy for next generation vaccines. Trends Biotechnol. 26, 659–667.

Effros, R.B., 2003. Problems and solutions to the development of vaccines in the elderly. Immunol. Allergy Clin. North Am. 23, 41–55.

Gauduin, M.C., Parren, P.W., Weir, R., Barbas, C.F., Burton, D.R., Koup, R.A., 1997. Passive immunization with ahumanmonoclonal antibody protects hu-PBL-SCIDmice against challenge by primary isolates of HIV-1. Nat. Med. 3, 1389–1393.

Gelder, C.M., Lambkin, R., Hart, K.W., Fleming, D., Williams, O.M., Bunce, M.,Welsh, K.I., Marshall, S.E., Oxford, J., 2002. Associations between human leukocyte antigens and nonresponsiveness to influenza vaccine. J. Infect. Dis. 185, 114–117.

Giuliani, M.M., Adu-Bobie, J., Comanducci, M., Arico, B., Savino, S., Santini, L., Brunelli, B., Bambini, S., Biolchi, A., Capecchi, B., Cartocci, E., Ciucchi, L., Di Marcello, F., Ferlicca, F., Galli, B., Luzzi, E., Masignani, V., Serruto, D., Veggi, D., Contorni, M., Morandi, M., Bartalesi, A., Cinotti, V., Mannucci, D., Titta, F., Ovidi, E., Welsch, J.A., Granoff, D., Rappuoli, R., Pizza, M., 2006. A universal vaccine for serogroup B meningococcus. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 103, 10834–10839.

Hatae, K., Kimura, A., Okubo, R., Watanabe, H., Erlich, H.A., Ueda, K., Nishimura, Y., Sasazuki, T., 1992. Genetic control of nonresponsiveness to hepatitis B virus vaccine by an extended HLA haplotype. Eur. J. Immunol. 22, 1899–1905.

Hohler, T., Reuss, E., Evers, N., Dietrich, E., Rittner, C., Freitag, C.M., Vollmar, J., Schneider, P.M., Fimmers, R., 2002. Differential genetic determination of immune responsiveness to hepatitis B surface antigen and to hepatitis A virus: a vaccination study in twins. Lancet 360, 991–995.

Hohler, T., Reuss, E., Freitag, C.M., Schneider, P.M., 2005. A functional polymorphism in the IL-10 promoter influences the response after vaccination with HBsAg and hepatitis A. Hepatology 42, 72–76.

Hyoty, H., Rasanen, L., Lehto, M., Tanhuanpaa, P., Eerola, A., Surcel, H.M., Ilonen, J., Leinikki, P., 1986. Cell-mediated and humoral immunity tomumpsvirus antigen. Acta Pathol. Microbiol. Immunol. Scand. C 94, 201–206.

Jacobson, R.M., Poland, G.A., 2004. The genetic basis for measles vaccine failure. Acta Paediatr. Suppl. 93, pp. 43–46; discussion 46–47.

Jacobson, R.M., Poland, G.A., Vierkant, R.A., Pankratz, V.S., Schaid, D.J., Jacobsen, S.J., Sauver, J.S., Moore, S.B., 2003. The association of class I HLA alleles and antibody levels after a single dose of measles vaccine. Hum. Immunol. 64, 103–109.

Jacobson, R.M., Ovsyannikova, I.G., Targonski, P.V., Poland, G.A., 2007. Studies of twins in vaccinology. Vaccine 25, 3160–3164.

Katz, J., Hancock, K., Veguilla, V., Zhong, W., Lu, X.H., Sun, H., Butler, E., Dong, L., Liu, F., Li, Z.N., DeVos, J., Gargiullo, P., Cox, N., 2009. Serum cross-reactive antibody response to a novel influenza A (H1N1) virus after vaccination with seasonal influenza vaccine. Morb. Mortal. Wkly. Rep. 58, 521–524.

210 C. Thomas, M. Moridani / Toxicology 278 (2010) 204–210 Kemper, A.R., Davis, M.M., Freed, G.L., 2002. Expected adverse events in a mass smallpox vaccination campaign. Eff. Clin. Pract. 5, 84–90.

Kulkarni, H., Marconi, V.C., Agan, B.K., McArthur, C., Crawford, G., Clark, R.A., Dolan, M.J., Ahuja, S.K., 2008. Role of CCL3L1-CCR5 genotypes in the epidemic spread of HIV-1 and evaluation of vaccine efficacy. PLoS One 3, e3671.

Lambkin, R., Novelli, P., Oxford, J., Gelder, C., 2004. Human genetics and responses to influenza vaccination: clinical implications. Am. J. Pharmacogenomics 4, 293–298.

Letvin, N.L., 2006. Progress and obstacles in the development of an AIDS vaccine. Nat. Rev. 6, 930–939.

Lieberman-Blum, S.S., Fung, H.B., Bandres, J.C., 2008. Maraviroc: a CCR5-receptor antagonist for the treatment of HIV-1 infection. Clin. Ther. 30, 1228–1250.

MacDonald, K.S., Fowke, K.R., Kimani, J., Dunand, V.A., Nagelkerke, N.J., Ball, T.B., Oyugi, J., Njagi, E., Gaur, L.K., Brunham, R.C., Wade, J., Luscher, M.A., Krausa, P., Rowland-Jones, S., Ngugi, E., Bwayo, J.J., Plummer, F.A., 2000. Influence of HLA supertypes on susceptibility and resistance to human immunodeficiency virus type 1 infection. J. Infect. Dis. 181, 1581–1589.

Mackenzie, J.S., Wetherall, J.D., Fimmel, P.J., Hawkins, B.R., Dawkins, R.L., 1977. Host factors and susceptibility to influenza A infection: the effect of ABO blood groups and HL-A antigens. Dev. Biol. Stand. 39, 355–362.

Mascola, J.R., Stiegler, G., VanCott, T.C., Katinger, H., Carpenter, C.B., Hanson, C.E., Beary, H., Hayes, D., Frankel, S.S., Birx, D.L., Lewis, M.G., 2000. Protection of

macaques against vaginal transmission of a pathogenic HIV-1/SIV chimeric virus by passive infusion of neutralizing antibodies. Nat. Med. 6, 207–210.

McBurney, S.P., Ross, T.M., 2008. Viral sequence diversity: challenges for AIDS vaccine designs. Expert Rev. Vaccines 7, 1405–1417.

McMichael, A.J., 2006. HIV vaccines. Annu. Rev. Immunol. 24, 227–255.

Mineta, M., Tanimura, M., Tana, T., Yssel, H., Kashiwagi, S., Sasazuki, T., 1996. Contribution of HLA class I and class II alleles to the regulation of antibody

production to hepatitis B surface antigen in humans. Int. Immunol. 8, 525–531.

Mitchell, L.A., 1999. Sex differences in antibody- and cell-mediated immune response to rubella re-immunisation. J. Med. Microbiol. 48, 1075–1080.

Muzzi, A., Masignani, V., Rappuoli, R., 2007. The pan-genome: towards a knowledgebased discovery of novel targets for vaccines and antibacterials. Drug Discov. Today 12, 429–439.

Newport, M.J., Goetghebuer, T., Weiss, H.A., Whittle, H., Siegrist, C.A., Marchant, A.,2004. Genetic regulation of immune responses to vaccines in early life. Genes Immun. 5, 122–129.

Ovsyannikova, I.G., Jacobson, R.M., Poland, G.A., 2004. Variation in vaccine response in normal populations. Pharmacogenomics 5, 417–427.

Ovsyannikova, I.G., Jacobson, R.M., Vierkant, R.A., Jacobsen, S.J., Pankratz, V.S., Poland, G.A., 2005a. Human leukocyte antigen class II alleles and rubella-specific humoral and cell-mediated immunity following measles-mumps-rubella-II vaccination.

J. Infect. Dis. 191, 515–519.

Ovsyannikova, I.G., Jacobson, R.M., Ryan, J.E., Vierkant, R.A., Pankratz, V.S., Jacobsen, S.J., Poland, G.A., 2005b. HLA class II alleles and measles virus-specific cytokine immune response following two doses of measles vaccine. Immunogenetics 56, 798–807.

Ovsyannikova, I.G., Ryan, J.E., Vierkant, R.A., Pankratz, V.S., Jacobson, R.M., Poland, G.A., 2005c. Immunologic significance of HLA class I genes in measles virus specific IFN-gamma and IL-4 cytokine immune responses. Immunogenetics 57,828–836.

Ovsyannikova, I.G., Dhiman, N., Jacobson, R.M., Poland, G.A., 2006. Human leukocyte antigen polymorphisms: variable humoral immune responses to viral vaccines. Expert Rev. Vaccines 5, 33–43.

Ovsyannikova, I.G., Jacobson, R.M., Dhiman, N., Vierkant, R.A., Pankratz, V.S., Poland, G.A., 2008. Human leukocyte antigen and cytokine receptor gene polymorphisms associated with heterogeneous immune responses to mumps viral vaccine. Pediatrics 121, e1091–e1099.

Parren, P.W., Marx, P.A., Hessell, A.J., Luckay, A., Harouse, J., Cheng-Mayer, C., Moore, J.P., Burton, D.R., 2001. Antibody protects macaques against vaginal challenge with a pathogenic R5 simian/human immunodeficiency virus at serum levels giving complete neutralization in vitro. J. Virol. 75, 8340–8347.

Pizza, M., Scarlato, V., Masignani, V., Giuliani, M.M., Arico, B., Comanducci, M., Jennings, G.T., Baldi, L., Bartolini, E., Capecchi, B., Galeotti, C.L., Luzzi, E., Manetti, R., Marchetti, E., Mora, M., Nuti, S., Ratti, G., Santini, L., Savino, S., Scarselli, M., Storni, E., Zuo, P., Broeker, M., Hundt, E., Knapp, B., Blair, E., Mason, T., Tettelin, H., Hood, D.W., Jeffries, A.C., Saunders, N.J., Granoff, D.M., Venter, J.C., Moxon, E.R., Grandi, G., Rappuoli, R., 2000. Identification of vaccine candidates against serogroup B meningococcus by whole-genome sequencing. Science 287, 1816–1820.

Poland, G.A., Ovsyannikova, I.G., Jacobson, R.M., Vierkant, R.A., Jacobsen, S.J., Pankratz, V.S., Schaid, D.J., 2001. Identification of an association between HLA class II alleles and low antibody levels after measles immunization. Vaccine 20, 430–438.

d

Poland, G.A., Ovsyannikova, I.G., Jacobson, R.M., Smith, D.I., 2007. Heterogeneity in vaccine immune response: the role of immunogenetics and the emerging field of vaccinomics. Clin. Pharmacol. Ther. 82, 653–664.

Poland, G.A., Ovsyannikova, I.G., Jacobson, R.M., 2008a. Vaccine immunogenetics:bedside to bench to population. Vaccine 26, 6183–6188.

Poland, G.A., Ovsyannikova, I.G., Jacobson, R.M., 2008b. Immunogenetics of seasonal influenza vaccine response. Vaccine 26 (Suppl. 4), D35–40.

Rappuoli, R., 2000. Reverse vaccinology. Curr. Opin. Microbiol. 3, 445–450.

Rappuoli, R., 2007. Bridging the knowledge gaps in vaccine design. Nat. Biotechnol. 25, 1361–1366.

Regnstrom, K.J., 2008. Pharmacogenomics in the preclinical development of vaccines: evaluation of efficacy and systemic toxicity in the mouse using array technology. Methods Mol. Biol. 448, 447–467.

Regnstrom, K., Ragnarsson, E.G., Rydell, N., Sjoholm, I., Artursson, P., 2002. Tetanus antigen modulates the gene expression profile of aluminum phosphate adjuvant in spleen lymphocytes in vivo. Pharmacogenomics J. 2, 57–64.

Reif, D.M., Motsinger-Reif, A.A., McKinney, B.A., Rock, M.T., Crowe Jr., J.E., Moore, J.H., 2009. Integrated analysis of genetic and proteomic data identifies biomarkers associated with adverse events following smallpox vaccination. Genes Immun. 10, 112–119.

Remarque, E.J., de Jong, J.M., van der Klis, R.J., Masurel, N., Ligthart, G.J., 1999. Dosedependent antibody response to influenza H1N1 vaccine component in elderly nursing home patients. Exp. Gerontol. 34, 109–115.

Ruh, M.F., Bi, Y., Cox, L., Berk, D., Howlett, A.C., Bellone, C.J., 1998. Effect of environmental estrogens on IL-1beta promoter activity in a macrophage cell line. Endocrine 9, 207–211.

Sekaly, R.P., 2008. The failed HIV Merck vaccine study: a step back or a launching point for future vaccine development? J. Exp. Med. 205, 7–12.

Serruto, D., Serino, L., Masignani, V., Pizza, M., 2009. Genome-based approaches to develop vaccines against bacterial pathogens. Vaccine 27, 3245–3250.

Shadan, S., 2004. Moving forward with reverse vaccinology. Drug Discov. Today 9,

386.

Spencer, M.J., Cherry, J.D., Terasaki, P.I., 1976. HL-A antigens and antibody response after influenza A vaccination. Decreased response associated with HL-A type W16. New Engl. J. Med. 294, 13–16.

Tatsuo, H., Ono, N., Tanaka, K., Yanagi, Y., 2000. SLAM (CDw150) is a cellular receptor for measles virus. Nature 406, 893–897.

Tettelin, H., Saunders, N.J., Heidelberg, J., Jeffries, A.C., Nelson, K.E., Eisen, J.A., Ketchum, K.A., Hood, D.W., Peden, J.F., Dodson, R.J., Nelson, W.C., Gwinn, M.L., DeBoy, R., Peterson, J.D., Hickey, E.K., Haft, D.H., Salzberg, S.L., White, O., Fleischmann, R.D., Dougherty, B.A., Mason, T., Ciecko, A., Parksey, D.S., Blair, E., Cittone, H., Clark, E.B., Cotton, M.D., Utterback, T.R., Khouri, H., Qin, H., Vamathevan, J., Gill, J., Scarlato, V., Masignani, V., Pizza, M., Grandi, G., Sun, L., Smith, H.O., Fraser, C.M., Moxon, E.R., Rappuoli, R., Venter, J.C., 2000. Complete genome sequence of Neisseria meningitidis serogroup B strain MC58. Science 287,

1809–1815.

Thomas, C., Weidanz, J., Ahsan, F., Moridani, M., 2009. Genomics in the development of vaccines. Int. Pharm. J. 24, 35–38.

Thorner, A.R., Barouch, D.H., 2007. HIV-1 vaccine development: progress and prospects. Curr. Infect. Dis. Rep. 9, 71–75.

Wang, C., Tang, J., Song, W., Lobashevsky, E., Wilson, C.M., Kaslow, R.A., 2004. HLA and cytokine gene polymorphisms are independently associated with responses to hepatitis B vaccination. Hepatology 39, 978–988.

Webster, R.G., 2000. Immunity to influenza in the elderly. Vaccine 18, 1686–1689. Xiang, Z., He, Y., 2009. Vaxign: a web based vaccine target design program for reversevaccinology. Procedia Vaccinol. 1, 23–29.

Yucesoy, B., Sleijffers, A., Kashon, M., Garssen, J., de Gruijl, F.R., Boland, G.J., van Hattum, J., Simeonova, P.P., Luster, M.I., van Loveren, H., 2002. IL-1beta gene polymorphisms influence hepatitis B vaccination. Vaccine 20, 3193–3196.